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Modeling Organic Chemical Reactions using Machine Learning

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Schimidt99/SECITEC2023

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MODELAGEM DE REAÇÕES QUÍMICAS ORGÂNICAS UTILIZANDO APRENDIZADO DE MÁQUINA


Neste trabalho apresentamos os resultados oriundos da modelagem de reações químicas orgânicas utilizando o software Marvin Sketch em conjunto com a biblioteca RDKit baseada na linguagem Python. Através da construção das reações químicas no software Marvin Sketch, e com a exportação das mesmas no formato SMARTS, estas podem ser interpretadas em algoritmos escritos em Python, da biblioteca RDKit, permitindo a previsão matemática dos produtos das reações.

ARQUIVOS (acessiveis acima):

  • alcanos.txt : lista de 15 moleculas de alcanos
  • reacoes_organicas_SECITEC2023.ipynb : Reações de substituição - halogenação de alcanos com Cloro
  • saida.txt : lista de 15 moleculas haletos clorados
  • haletos.txt : lista de 15 moleculas haletos clorados
  • reacoes_organicas2_SECITEC2023.ipynb : Reações de substituição nucleofílica - ataque do haleto pelo NaCN
  • saida2.txt : lista de 15 moleculas cianetos orgânicos

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MODELING ORGANIC CHEMICAL REACTIONS USING MACHINE LEARNING


In this work we present the results from the modeling of organic chemical reactions using the Marvin Sketch software in conjunction with the RDKit library based on the Python language. By constructing chemical reactions in the Marvin Sketch software, and exporting them in SMARTS format, they can be interpreted in algorithms written in Python, from the RDKit library, allowing the mathematical prediction of the reaction products.

FILES (accessible above):

  • alcanos.txt : list of 15 alkane molecules
  • reacoes_organicas_SECITEC2023.ipynb : Substitution reactions - halogenation of alkanes with chlorine
  • saida.txt : list of 15 chlorinated halide molecules
  • haletos.txt : list of 15 chlorinated halide molecules
  • reacoes_organicas2_SECITEC2023.ipynb : Nucleophilic substitution reactions - halide attack by NaCN
  • saida2.txt : list of 15 organic cyanide molecules

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