Fix: 開発の便宜のため、開発版 (999.999.999) のみ常にプロジェクトファイルと設定ファイルのマイグレーションを行う

Fix: 開発の便宜のため、開発版 (999.999.999) のみ常にプロジェクトファイルと設定ファイルのマイグレーションを行う #28