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Unzip this directory and view - the exemplar connections using ``mrview`` to ensure + the exemplar connections (one is created for each nonzero edge + in the connectivity matrix) using ``mrview`` to ensure that you're seeing the expected shapes of connections. streamlines: diff --git a/qsirecon/data/scalars/dsistudio_gqi.yaml b/qsirecon/data/scalars/dsistudio_gqi.yaml index 4a887c7e..748f0cdb 100644 --- a/qsirecon/data/scalars/dsistudio_gqi.yaml +++ b/qsirecon/data/scalars/dsistudio_gqi.yaml @@ -3,7 +3,7 @@ ad_file: model: tensor param: ad metadata: - Description: AD + Description: Apparent Diffusivity from a tensor fit dti_fa_file: bids: model: tensor @@ -21,25 +21,25 @@ ha_file: model: tensor param: ha metadata: - Description: HA + Description: Helix Angle from tensor fit iso_file: bids: model: gqi param: iso metadata: - Description: Isotropic Diffusion + Description: Isotropic Diffusion from GQI md_file: bids: model: tensor param: md metadata: - Description: Mean Diffusivity + Description: Mean Diffusivity from a tensor fit qa_file: bids: model: gqi param: qa metadata: - Description: Fractional Anisotropy from a tensor fit + Description: Quantitative Anisotropy from a GQI fit rd1_file: bids: model: rdi diff --git a/qsirecon/data/tests/crash_files/crash-20170905-182839-root-dvars-b78e9ea8-e295-48a1-af71-2d36afd9cebf.txt b/qsirecon/data/tests/crash_files/crash-20170905-182839-root-dvars-b78e9ea8-e295-48a1-af71-2d36afd9cebf.txt deleted file mode 100644 index 82fed3bc..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/crash_files/crash-20170905-182839-root-dvars-b78e9ea8-e295-48a1-af71-2d36afd9cebf.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -Node: qsirecon_wf.single_subject_100185_wf.func_preproc_task_machinegame_run_01_wf.bold_confounds_wf.dvars -Working directory: /scratch/qsirecon_wf/single_subject_100185_wf/func_preproc_task_machinegame_run_01_wf/bold_confounds_wf/dvars - -Node inputs: - -figdpi = 100 -figformat = png -figsize = (11.7, 2.3) -ignore_exception = False -in_file = /scratch/qsirecon_wf/single_subject_100185_wf/func_preproc_task_machinegame_run_01_wf/bold_reg_wf/merge/vol0000_trans_merged.nii.gz -in_mask = /scratch/qsirecon_wf/single_subject_100185_wf/func_preproc_task_machinegame_run_01_wf/bold_reg_wf/mask_t1w_tfm/ref_image_corrected_brain_mask_maths_trans.nii.gz -intensity_normalization = 1000.0 -remove_zerovariance = True -save_all = True -save_nstd = False -save_plot = False -save_std = True -save_vxstd = False -series_tr = - -Traceback (most recent call last): - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/niworkflows/nipype/pipeline/plugins/multiproc.py", line 52, in run_node - result['result'] = node.run(updatehash=updatehash) - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/niworkflows/nipype/pipeline/engine/nodes.py", line 372, in run - self._run_interface() - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/niworkflows/nipype/pipeline/engine/nodes.py", line 482, in _run_interface - self._result = self._run_command(execute) - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/niworkflows/nipype/pipeline/engine/nodes.py", line 613, in _run_command - result = self._interface.run() - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/niworkflows/nipype/interfaces/base.py", line 1083, in run - runtime = self._run_wrapper(runtime) - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/niworkflows/nipype/interfaces/base.py", line 1031, in _run_wrapper - runtime = self._run_interface(runtime) - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/niworkflows/nipype/algorithms/confounds.py", line 143, in _run_interface - intensity_normalization=self.inputs.intensity_normalization) - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/niworkflows/nipype/algorithms/confounds.py", line 786, in compute_dvars - 1)[:, 0] - File "/usr/local/miniconda/lib/python3.6/site-packages/numpy/lib/shape_base.py", line 91, in apply_along_axis - res = func1d(arr[tuple(i.tolist())], *args, **kwargs) -IndexError: index 0 is out of bounds for axis 0 with size 0 -Interface ComputeDVARS failed to run. diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_conform.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_conform.html deleted file mode 100644 index e51bf441..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_conform.html +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -

Anatomical Conformation

- diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_reconall.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_reconall.html deleted file mode 100644 index 05e94d8f..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_reconall.html +++ /dev/null @@ -1,758 +0,0 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_summary.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_summary.html deleted file mode 100644 index 2e4026b5..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_summary.html +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -

Summary

- diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_2_mni.svg b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_2_mni.svg deleted file mode 100644 index bb54ca87..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_2_mni.svg +++ /dev/null @@ -1,1202 +0,0 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_seg.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_seg.html deleted file mode 100644 index 91e71dca..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_seg.html +++ /dev/null @@ -1,799 +0,0 @@ -
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FAST: segmentation over anatomical

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\ No newline at end of file diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_skull_strip.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_skull_strip.html deleted file mode 100644 index eb826045..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/anat/sub-01_T1w_t1_skull_strip.html +++ /dev/null @@ -1,605 +0,0 @@ -
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ANTS BrainExtraction: brain mask over anatomical input

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\ No newline at end of file diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_acompcor.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_acompcor.html deleted file mode 100644 index eda248d0..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_acompcor.html +++ /dev/null @@ -1,640 +0,0 @@ -
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aCompCor ROI

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\ No newline at end of file diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_bbr.svg b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_bbr.svg deleted file mode 100644 index 2b76e7d9..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_bbr.svg +++ /dev/null @@ -1,1560 +0,0 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_bold_mask.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_bold_mask.html deleted file mode 100644 index 02ff99e8..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_bold_mask.html +++ /dev/null @@ -1,604 +0,0 @@ -
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Brain mask

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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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\ No newline at end of file diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_ica_aroma.svg b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_ica_aroma.svg deleted file mode 100644 index 0f22d773..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_ica_aroma.svg +++ /dev/null @@ -1,563 +0,0 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_tcompcor.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_tcompcor.html deleted file mode 100644 index 10b042fe..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_tcompcor.html +++ /dev/null @@ -1,643 +0,0 @@ -
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tCompCor - high variance voxels

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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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\ No newline at end of file diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_validation.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-01_bold_validation.html deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_acompcor.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_acompcor.html deleted file mode 100644 index 48fefe7b..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_acompcor.html +++ /dev/null @@ -1,641 +0,0 @@ -
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aCompCor ROI

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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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\ No newline at end of file diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_bbr.svg b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_bbr.svg deleted file mode 100644 index 9dd0664f..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_bbr.svg +++ /dev/null @@ -1,1560 +0,0 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_bold_mask.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_bold_mask.html deleted file mode 100644 index cd8b5c39..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_bold_mask.html +++ /dev/null @@ -1,601 +0,0 @@ -
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Brain mask

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\ No newline at end of file diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_ica_aroma.svg b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_ica_aroma.svg deleted file mode 100644 index 91267cea..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_ica_aroma.svg +++ /dev/null @@ -1,677 +0,0 @@ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_tcompcor.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_tcompcor.html deleted file mode 100644 index 8ac25385..00000000 --- a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_tcompcor.html +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -
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tCompCor - high variance voxels

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\ No newline at end of file diff --git a/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_validation.html b/qsirecon/data/tests/work/reportlets/fmriprep/sub-01/func/sub-01_task-mixedgamblestask_run-02_bold_validation.html deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000