-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 55
/
Copy pathtach.toml
117 lines (104 loc) · 1.94 KB
/
tach.toml
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
interfaces = []
exclude = [
"**/*__pycache__",
"**/*egg-info",
"LICENSE",
"build",
"docs",
"tests",
"venv",
]
source_roots = [
"sub-packages/bionemo-core/src",
"sub-packages/bionemo-esm2/src",
"sub-packages/bionemo-evo2/src",
"sub-packages/bionemo-example_model/src",
"sub-packages/bionemo-fw/src",
"sub-packages/bionemo-geneformer/src",
"sub-packages/bionemo-geometric/src",
"sub-packages/bionemo-llm/src",
"sub-packages/bionemo-scdl/src",
"sub-packages/bionemo-size-aware-batching/src",
"sub-packages/bionemo-testing/src",
"sub-packages/bionemo-webdatamodule/src",
]
[[modules]]
path = "bionemo.core"
depends_on = []
[[modules]]
path = "bionemo.esm2"
depends_on = [
"bionemo.core",
"bionemo.llm",
]
[[modules]]
path = "bionemo.evo2"
depends_on = [
"bionemo.noodles",
"bionemo.core",
"bionemo.llm",
]
[[modules]]
path = "bionemo.example_model"
depends_on = [
"bionemo.core",
"bionemo.llm",
]
[[modules]]
path = "bionemo.fw"
depends_on = [
"bionemo.core",
"bionemo.esm2",
"bionemo.geneformer",
"bionemo.geometric",
"bionemo.llm",
"bionemo.noodles",
"bionemo.noodles",
"bionemo.scdl",
"bionemo.size_aware_batching",
"bionemo.webdatamodule",
]
[[modules]]
path = "bionemo.geneformer"
depends_on = [
"bionemo.core",
"bionemo.llm",
"bionemo.scdl",
]
[[modules]]
path = "bionemo.geometric"
depends_on = [
"bionemo.core",
]
[[modules]]
path = "bionemo.llm"
depends_on = [
"bionemo.core",
]
[[modules]]
path = "bionemo.noodles"
depends_on = [
"bionemo.core",
]
[[modules]]
path = "bionemo.scdl"
depends_on = [
"bionemo.core",
]
[[modules]]
path = "bionemo.size_aware_batching"
depends_on = [
"bionemo.core",
]
[[modules]]
path = "bionemo.testing"
depends_on = [
"bionemo.core",
"bionemo.llm",
]
[[modules]]
path = "bionemo.webdatamodule"
depends_on = [
"bionemo.core",
"bionemo.llm",
]